כאשר מערכות צנרת מבודדות נכשלות, תשומת הלב מתמקדת בדרך כלל בנושאים כמו נזק למעטפת המגן החיצונית או חדירת מים לתוך קצף הבידוד. עם זאת, קיים תרחיש ערמומי יותר: צינור הפלדה משיתד מבפנים, מה שגורם לרוב לפרצה מוחלטת עד לגילוי הבעיה.
קורוזיה פנימית נגרמת בעיקר מתכונות המדיום המועבר עצמו. ברשתות מים חמים, טיפול לקוי במים מאפשר לחמצן מומס ופחמן דו חמצני לשתות את הדופן הפנימית של הצינור. בצינורות קיטור, הקיטור עלול לשאת גזים קורוזיביים-כגון פחמן דו חמצני או מימן גופרתי-התוקפים באופן דומה את הקיר הפנימי. טמפרטורות גבוהות מאיצות תהליך זה; ככל שהטמפרטורה גבוהה יותר, כך תגובת הקורוזיה מהירה יותר וקיר הצינור מתדלדל מהר יותר.
גורם נוסף הוא טיפול לא הולם בקיר הפנימי. בעוד שצינורות פלדה עוברים הסרת חלודה לפני היציאה מהמפעל, איכות תהליך זה משתנה משמעותית בין היצרנים. אם הסרת החלודה אינה שלמה, שאריות חלודה ואבנית טחנה יכולים לשמש כנקודות התחלה לקורוזיה. קורוזיה בבור שנצפתה על הדפנות הפנימיות של חלק מהצינורות לאחר שנים של פעילות נובעת לרוב מפגמים מיקרוסקופיים אלו.
הסכנה של קורוזיה פנימית טמונה בקושי לזהות אותה. בעיות כמו נזק למארז החיצוני או ריבוי מים בקצף מציגים בדרך כלל סימני אזהרה גלויים, כגון אזעקות לגילוי נזילות או קיטור העולה מהקרקע. קורוזיה פנימית, לעומת זאת, מתרחשת בתוך הצינור; הקיר מתדלדל בהדרגה עד שהוא לא יכול יותר לעמוד בלחץ ולפתע נקרע. יתר על כן, קשה לתקן קורוזיה פנימית, בעוד שקורוזיה חיצונית ניתן לרוב לתקן על ידי חפירה וריתוך של תיקון; קורוזיה פנימית מחייבת לעתים קרובות להחליף את כל חלק הצינור.
מניעת קורוזיה פנימית מסתמכת על שלושה קווי הגנה עיקריים: ראשית, בחירת חומרי צינור עמידים- בפני קורוזיה או מריחת ציפוי- נגד קורוזיה על הקיר הפנימי; שנית, הוספת מעכבי קורוזיה למדיום המועבר כדי להפחית את מידת הקורוזיציה שלו; ושלישית, ניטור קבוע של איכות המים במהלך הפעולה כדי לשמור על רמות חמצן מומס וערכי pH בטווחים המתאימים. במהלך הרכש, רצוי לשים לב לדרגת הסרת החלודה של הקיר הפנימי ולתהליך הטיפול נגד-קורוזיה, שכן אלו הם גורמים קריטיים הקובעים את אורך החיים של פנים הצינור.